תחילת פעילות ההובלה באזור עמק הירדן הייתה  בשלהי 1938 בעת שמספר משקים התאגדו והקימו בעמק אגודה שיתופית לשירותי הובלת תוצרת חקלאית.

בתחילת שנות ה-40 עם התחזקות הקיבוצים ובאישור השלטונות הבריטיים הקימו אגודה שיתופית חקלאית – משרד להובלה ששמו נקרא "ארגון הובלה עמק הירדן".

הובלת מטענים לחלקי הארץ, פרי התפרנסותם של חקלאי ותעשייני האזור היה הבסיס לקיום כלכלי של הענף מהיום הראשון של ההתיישבות בעמק וכך גם בראיית העתיד היות והאזור מרוחק יחסית משאר חלקי הארץ.

האגודה פעלה במשך 70 שנה והתפתחה לכיווני פעילות שונים בשירות משקי האזור.

במשך השנים התאימה האגודה את אופי הפעילות ודרך ההתנהלות לצרכים המודרניים הן בהיבט הכלכלי והן בהיבט הטכני והוסיפה לפעילות סוגי הובלה נוספים כגון: דלקים, כימיקלים, תפזורת למספוא בהמות חומרי גלם לתעשייה ועוד.

בשנת 2012 בהחלטה משותפת של כל משקי ההובלה הבעלים ובמטרה להתאים את מבנה החברה לשוק ההובלה המשתנה, נעשה שינוי מבני.

זכויות ההובלה נמכרו והוקמה חברת "עמק הירדן חברה להובלה בע"מ" בבעלות משותפת של "צמח מפעלים" ו"קבוצת תעבורה".

בבעלות החברה צי חדיש של משאיות בגדלים שונים ומצויד בטכנולוגיה מתקדמת להפחתת הרעלים בגזי הפליטה, לשמירה על איכות הסביבה. צי משאיות זה, מהווה בסיס המאפשר לחברה לעמוד ביעדיה.

כמו כן, "עמק הירדן" מצוידת בצי גדול של נגררים מסוגים שונים וציוד חדיש המתאים לביצוע יעיל של סוגי הובלה מגוונים.

החברה פועלת ומקפידה על הפעלת הציוד והמערכות בתנאי בטיחות כמתחייב.

החברה מקפידה על יחס אמין והוגן לעובדיה, דבר המשפיע ישירות על יחסם לחברה, ללקוחות והתפקוד היומיומי.

החברה מחויבות ליישום דרישות התקן הבינלאומי :  9001:2008 ISO